現在は、時間に余裕のある試験方式に変更されています。
空白行＝減点になる訳ではないと思いますが、空白の分、中身は薄いことになります。（あるいは中身が薄い印象を与えます）。上位２０％に入るためには、最後まできっちり埋める必要があります。
技術士試験参考書の選び方
３．参考書の選び方
１３．最後に数行空いている
ダメな技術士論文とはこの記事は約1分で読めます。
ダメな技術士論文とは