現在は、時間に余裕のある試験方式に変更されています。
空白行＝減点になる訳ではないと思いますが、空白の分、中身は薄いことになります。（あるいは中身が薄い印象を与えます）。上位２０％に入るためには、最後まできっちり埋める必要があります。
技術士合格体験記（総合技術監理部門）
１２．技術的体験論文作成その１（総合技術監理部門合格体験記）
１３．最後に数行空いている
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ダメな技術士論文とは